מערך הפיקוח פועל למניעת מחלות מדבקות בדרכים הבאות:
א) הסברה והדרכת המגדלים - למנוע הפצת מחלות ע"י ביצוע נכון של חיסונים והגברת המודעות לבטיחות ביולוגית.
ב) פיקוח בהתאם לתחיקה בנושא רפואה וטרינרית.
ג) נקיטת אמצעים משפטיים, במידת הצורך.
ההסברה והפיקוח מתמקדים בנושאים הבאים:
א) פקודת מחלות בעלי חיים, תחיקה וטרינרית ומניעת הפצת מחלות.
ב) הסדר תנועת בעלי חיים.
ג) מחלות נגיפיות רשומות.
ד) פיקוח על מצרכים ושירותים (מדגריות).
ה) חיסונים ומחסנים מורשים.
ו) פיקוח פעילות והסברה באזורים נגועים או חשודים כנגועים.
ז) בטיחות ביולוגית בהתאם לשלוחות השונות.
פעולות ההסברה והפיקוח מתבצעות בשלוחות הבאות:
א) פיטום תרנגולות.
ב) פיטום תרנגולי הודו.
ג) גידול פרגיות והודנים.
ד) מטילות ביצי מאכל.
ה) משקי רבייה.
ו) מדגריות.
דרכי הפיקוח על ביצוע חיסונים:
א) ביקורות פתע במשקים ובמדגריות.
ב) ביקורות בתאום מראש במשקים ובמדגריות.
ג) ביקורות יזומות על בסיס קבלת מידע.
פעילות המערך באזורים נגועים או חשודים כנגועים:
א) הכרזת אזורים נגועים ( הטלת הסגרים ).
ב) ביצוע תחקירים אפידמיולוגיים.
ג) מיפוי האזור והמשקים ברדיוס של 3 ק"מ ו - 10 ק"מ.
ד) לקיחת דוגמאות לבדיקות למעבדה האזורית.
ה) פיקוח על ביצוע חיסונים.
ו) הודעה והדרכת כל הגורמים באזור: מגדלים, מזכירויות בישובים, מכוני תערובת, מנהלי מדגריות.
ז) הקפדה על תנועת בע"ח ודרכי סילוק פגרים.
ח) הדרכה בכל הנושא של בטיחות ביולוגית באזור.
ט) פיקוח על ניקיון וחיטוי לאחר המתה של עופות, קבירת רפד, תערובת.
י) דיווחים שוטפים לממונה, למנהל האזור, לרופא וטרינר ראשי למחלות עופות בכל הקשור לפעילות וזאת ע"י מילוי דוחות:
· דוח חיסונים.
· דוח אפידמיולוגי.
· דוח המתת עופות, כולל ניקוי וחיטוי.
· דוח אירועים חריגים.
יא) ביצוע כל פעילות נדרשת בהתאם לדרישת רופא וטרינר ממשלתי למחלות עופות.
מערך הפיקוח במדגריות, משקי גידול ומשקי רביה
העובדים במערך מבצעים את הפעילויות הבאות:
א. בדיקות תברואה במדגריות ומשקי רביה:
1. סליידים (ספירת חיידקים כללית).
2. מטוש נגרר (תכנית בקרה לסלמונלה).
3. סבורו (פטריות).
4. דגימות דם (בלהקות רביה של תרנגולי הודו, באופן קבוע).
ב. בדיקות במשקים ריקים (למתן היתרי הפעלה):
1. ביקורת תנאים.
2. מטוש נגרר (תכנית בקרה סלמונלה).
ג. יבוא: אישור מקום הסגר, דיגום בשדה התעופה, פיקוח ובדיקות בתקופת ההסגר.
ד. הקמת משקים חדשים: ליווי התהליך, החל מבדיקת התנאים בשטח ועד למתן האישור הסופי להקמה והחזקה.
ה. השמדות: ליווי ופיקוח בשלבי הביצוע והכנת המסמכים.