היחידה לפיקוח על מוצרים מהחי בשירותים הווטרינריים אחראית להפעלת הפיקוח הווטרינרי על עיבודם, ייצורם, ושיווקם של מוצרי מזון מהחי בארץ ולחו"ל. פעילות היחידה מתמקדת בתחומים הבאים:1. בתי שחיטה לבעלי כנף ויענים.2. תחנות מיון ואריזה של ביצי מאכל.3. חוות גידול, תחנות מיון ואריזה של דגי בריכות, ודגים שמקורם בגידול מבוקר בים.4. מפעלים המאושרים לעיבוד תוצרת מהחי ליצוא בתחומים הבאים:א. מפעלים לעיבוד בשר עוף ויענים ליצוא.ב. מפעלים לעיבוד ביצים ומוצריהם ליצוא.ג. מפעלים לעיבוד דגים ומוצריהם ליצוא. ד. מפעלים לעיבוד חלב ומוצריו ליצוא.